20世纪末,世界各地的天才少年组成了一个名为炼金之星的组织,其成员之一的高山我梦,作为XIG的一员,靠大地给予的红光变身成盖亚·奥特曼后,投入了同CRISIS计算机所预测到的根源性灭亡招来体进行的誓死决战中另一方面,已脱离炼金之星的藤宫博也坚定地认为,对于地球而言,人类才是真正的癌细胞。他凭着蓝光的威力,变身成与盖亚相对立的蓝色奥特曼阿古茹·奥特曼。
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